Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL4BQ13620 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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