Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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