Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms