Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms