Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD4Q13485 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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