Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ANK3Q12955 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms