Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNA1Q09470 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms