Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CD164Q04900 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms