Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms