Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms