Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GCNT1Q02742 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms