Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms