Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms