Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FAM3AP98173 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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