Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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