Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDST1P52848 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDST1P52848 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDST1P52848 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDST1P52848 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDST1P52848 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDST1P52848 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDST1P52848 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDST1P52848 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDST1P52848 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDST1P52848 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDST1P52848 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDST1P52848 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDST1P52848 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDST1P52848 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDST1P52848 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDST1P52848 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDST1P52848 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDST1P52848 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms