Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF135P52742 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms