Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCA4P51532 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms