Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB27AP51159 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms