Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLCSP50747 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLCSP50747 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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