Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms