Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PXNP49023 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PXNP49023 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PXNP49023 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PXNP49023 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PXNP49023 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PXNP49023 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PXNP49023 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PXNP49023 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms