Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCLMP48507 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCLMP48507 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCLMP48507 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCLMP48507 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCLMP48507 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCLMP48507 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCLMP48507 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCLMP48507 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCLMP48507 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCLMP48507 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCLMP48507 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GCLMP48507 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms