Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms