Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms