Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms