Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms