Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GJA4P35212 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms