Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GPC1P35052 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GPC1P35052 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GPC1P35052 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GPC1P35052 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GPC1P35052 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GPC1P35052 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GPC1P35052 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GPC1P35052 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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GPC1P35052 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GPC1P35052 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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