Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCAP28676 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms