Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IL3RAP26951 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms