Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPI1P17947 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPI1P17947 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SPI1P17947 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms