Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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