Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NME1P15531 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NME1P15531 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NME1P15531 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms