Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCL2P13500 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL2P13500 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCL2P13500 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CCL2P13500 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCL2P13500 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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