Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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FAM58BPP0C7Q3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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FAM58BPP0C7Q3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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FAM58BPP0C7Q3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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FAM58BPP0C7Q3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM58BPP0C7Q3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FAM58BPP0C7Q3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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FAM58BPP0C7Q3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FAM58BPP0C7Q3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FAM58BPP0C7Q3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FAM58BPP0C7Q3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FAM58BPP0C7Q3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM58BPP0C7Q3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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