Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACSL3O95573 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms