Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SCN2BO60939 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCN2BO60939 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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