Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP9BO43861 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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