Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF1O43189 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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