Protein–RNA interactions for Protein: O14526

FCHO1, F-BAR domain only protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1O14526 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FCHO1O14526 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms