Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms