Protein–RNA interactions for Protein: D6RBM5

USP17L23, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L23D6RBM5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
USP17L23D6RBM5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms