Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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