Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9Y3F1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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