Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMG5Q9UPR3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms