Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms