Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLCO3A1Q9UIG8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms