Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH4Q9UIA0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH4Q9UIA0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms