Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM5BQ9UGL1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms